Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28919A0A087WP35 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28919A0A087WP35 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms