Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc166S4R181 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms