Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top3bQ9Z321 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top3bQ9Z321 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms