Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a4Q9Z306 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a4Q9Z306 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms