Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn8Q9Z260 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms