Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccne2Q9Z238 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne2Q9Z238 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne2Q9Z238 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms