Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgr5Q9Z1P4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms