Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek4Q9Z1J2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms