Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfkbiaQ9Z1E3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms