Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dctn3Q9Z0Y1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dctn3Q9Z0Y1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms