Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb6Q9Z0T9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb6Q9Z0T9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms