Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn1Q9Z0I7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms