Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lhx9Q9WUH2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lhx9Q9WUH2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx9Q9WUH2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx9Q9WUH2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx9Q9WUH2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx9Q9WUH2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx9Q9WUH2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx9Q9WUH2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx9Q9WUH2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx9Q9WUH2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lhx9Q9WUH2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lhx9Q9WUH2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms