Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Scnn1bQ9WU38 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scnn1bQ9WU38 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms