Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms