Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK0

Nupr1, Nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupr1Q9WTK0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupr1Q9WTK0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nupr1Q9WTK0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms