Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hic1Q9R1Y5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hic1Q9R1Y5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hic1Q9R1Y5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms