Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Abcc6Q9R1S7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms