Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc26a4Q9R155 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc26a4Q9R155 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc26a4Q9R155 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms