Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms