Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf4Q9QZS2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf4Q9QZS2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms