Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn4Q9QXZ9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn4Q9QXZ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms