Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms