Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phc2Q9QWH1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phc2Q9QWH1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phc2Q9QWH1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Phc2Q9QWH1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phc2Q9QWH1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phc2Q9QWH1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phc2Q9QWH1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phc2Q9QWH1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phc2Q9QWH1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc2Q9QWH1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc2Q9QWH1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms