Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rai2Q9QVY8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rai2Q9QVY8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms