Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkain4Q9JMG4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkain4Q9JMG4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms