Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfmbt1Q9JMD1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfmbt1Q9JMD1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms