Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rabgef1Q9JM13 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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