Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cul3Q9JLV5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms