Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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Nectin3Q9JLB9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Nectin3Q9JLB9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Nectin3Q9JLB9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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Nectin3Q9JLB9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin3Q9JLB9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Nectin3Q9JLB9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Nectin3Q9JLB9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Nectin3Q9JLB9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Nectin3Q9JLB9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Nectin3Q9JLB9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms