Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prg3Q9JL95 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg3Q9JL95 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms