Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmx1aQ9JKU8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms