Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx6Q9JKK1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms