Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl39Q9JKF7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms