Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3m1Q9JKC8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms