Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ybx3Q9JKB3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ybx3Q9JKB3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms