Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga3Q9JJZ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms