Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrip3Q9JJR9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip3Q9JJR9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms