Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akip1Q9JJR5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Akip1Q9JJR5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms