Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FliiQ9JJ28 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FliiQ9JJ28 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms