Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r3fQ9JIG4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms