Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI71

Dll4, Delta-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll4Q9JI71 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dll4Q9JI71 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dll4Q9JI71 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms