Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pus3Q9JI38 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms