Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtaQ9JHK4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
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