Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz2Q9JHH9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz2Q9JHH9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms