Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cxcl11Q9JHH5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms