Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tnfrsf13bQ9ET35 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tnfrsf13bQ9ET35 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13bQ9ET35 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13bQ9ET35 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13bQ9ET35 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13bQ9ET35 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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