Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DysfQ9ESD7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DysfQ9ESD7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms