Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms