Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr6Q9EQ16 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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